昨日,华大集团旗下子公司——华大智造发布了其自主研发的最新超高通量基因测序仪——“MGISEQ-T7”。这台拥有超高通量的基因测序仪一天就可以完成60例个人全基因组测序,日产出数据高达6Tb,是目前全球日生产能力最强的基因测序仪,堪称“超级生命计算机”。
这是华大继3年前实现测序仪国产化的又一次突破,使其成为全球唯一一个有能力构建一条从硬件制造到基因测序服务,再到大数据研究的完整基因测序产业链的机构。该款设备的发布也进一步降低了基因组测序的成本,让“基因组测序100美元”时代加快来临。
6台机器1年可完成十万人基因组测序
在人体的基因中,有30亿个碱基对,要想测出它的全部序列,高通量、快速的测序仪是关键。从国家战略的层面,高通量基因测序仪的重要性不言而喻。而从基因测序整个产业来看的话,测序仪是产业链最为重要的一环。
在行业上游基本处于国外寡头垄断的状态下,深圳企业凭借自主创新“争上游”,频频传来好消息。
昨天,在深圳举行的第十三届国际基因组学大会上,华大智造发布了其自主研发的最新超高通量基因测序仪——“MGISEQ-T7”,大大提高基因测序效率。
华大集团执行副总裁、华大智造首席执行官牟峰表示,由于受到设备数量、速度和成本等原因的制约,全球基因组的测序效率在前几年推进并不顺利。以英国为例,2012年12月,英国启动十万人基因组计划,花了5年半的时间才完成7万多例全基因组测序。
“超快速、超高通量的T7,堪称超级生命计算机。”牟峰介绍,一台T7日产出数据高达6Tb,是目前全球日生产能力最强的基因测序仪,一天就可以完成60例个人全基因组测序。以前,十万人级别的基因组测序可能需要4-6年的时间才能完成。现在,仅需6台T7,一年时间即可完成。
全球首创4联芯片“以一敌四”
这台基因测序仪如何做到又快又强的?牟峰介绍说,目前,市场上所有的测序仪最多只能支持两张芯片同时运行,而T7的4联芯片平台采用独特的芯片搭载技术,可实现4张芯片进行完全独立的测序流程,如同4台测序仪同时进行工作,且芯片间互不影响。
测序仪运行速度的快慢将直接影响到测序项目的交付时间,因此,业界始终致力于提升测序仪的运行速度。华大智造通过全面升级生化系统、光学系统,并将图像数据处理速度提升15倍,从而使得T7测序速度提升到行业最高水平的50%以上,远远领先于其他测序仪。
牟峰告诉记者,测序仪芯片密度越高,意味着可产出更多的有效数据量。T7将原有的芯片密度提高了20%,使得单张芯片即可实现Tb级数据产出。加之4张芯片可同时独立运行,24小时无休轮转,T7每天最多可产出6Tb数据,真正实现强大日生产能力。
加快实现“100美元全基因组测序”
“我们通量是全世界最高的近两倍,我们的价格也是做到非常低的水平,最接近‘100美金完成一个人全基因组测序’的目标。”华大智造执行副总裁刘健告诉记者,这必将对目前测序产业的发展起到强有力的推动作用,也标志着基于基因检测的精准医学研究全面进入大数据时代成为可能。
据介绍,基因测序技术促进精准医疗,让罕见病的检测变得容易、便宜,找出基因变异与疾病之间的关联。这项技术虽好,但成本不低,特别是基因测序的价格在早期曾让人可望而不可及——10年前测量一个人的全基因组数据需要30万美元,如今已降至1000美元左右。
为了让基因测序的产品从“阳春白雪”走向平常百姓家,业内一直以“100美元全基因组测序”为目标,到那时,以基因测序为基础的精准医疗产业才能真正驶上快车道。
刘健向记者透露:“今天做一个全基因组测序,目前价格最低还是华大的600美元,其他的很多还是800或1000美元,虽然不能说具体的数字,但是在一定量的情况下,华大能率先进入从1000美元到100美元冲刺的后半段的。”
(来源:深圳特区报 记者 闻坤)